Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mccc1Q99MR8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mccc1Q99MR8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms