Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkd1Q99MH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms