Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms