Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdca3Q99M54 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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