Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms