Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms