Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lysmd3Q99LE3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lysmd3Q99LE3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms