Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SardhQ99LB7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SardhQ99LB7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SardhQ99LB7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SardhQ99LB7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SardhQ99LB7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms