Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms