Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PpifQ99KR7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms