Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf34Q99KR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms