Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hps4Q99KG7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms