Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms