Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms