Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spef1Q99JL1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spef1Q99JL1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms