Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Ddb2Q99J79 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Ddb2Q99J79 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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