Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn16Q925N4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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