Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim7Q923T7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms