Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clip1Q922J3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms