Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EedQ921E6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms