Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Pde6cQ91ZQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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