Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdc42ep1Q91W92 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms