Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms