Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klc3Q91W40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Klc3Q91W40 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms