Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps3Q91VB4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms