Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cabp4Q8VHC5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms