Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71Q8VEG0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms