Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg8Q8VE18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms