Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms