Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Reep2Q8VCD6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Reep2Q8VCD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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