Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GcaQ8VC88 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms