Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmpQ8R373 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms