Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc12Q8R344 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc12Q8R344 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms