Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim29Q8R2Q0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms