Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmn1r200Q8R281 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r200Q8R281 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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