Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2afjQ8R1M2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2afjQ8R1M2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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H2afjQ8R1M2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2afjQ8R1M2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2afjQ8R1M2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2afjQ8R1M2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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