Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CipcQ8R0W1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms