Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f4Q8R0K9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms