Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hecw1Q8K4P8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms