Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm1Q8K377 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm1Q8K377 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Lrrtm1Q8K377 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm1Q8K377 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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