Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms