Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc12Q8K2L8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Trappc12Q8K2L8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc12Q8K2L8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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