Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd3Q8K2F0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms