Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd3Q8K2C9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms