Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fcho1Q8K285 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Fcho1Q8K285 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fcho1Q8K285 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fcho1Q8K285 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms