Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1eQ8K202 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1eQ8K202 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms