Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms