Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnppd1Q8K158 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms