Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne5Q8JZW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms