Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmgcll1Q8JZS7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms